由于沼气工程中各种原料的收集渠道和理化性状不一，各种消化工艺对原料的处理要求和输送方式不一，使得原料预处理环节不仅复杂而且难度加大。近些年随着社会主义新农村建设工程的推进，利用干稻草、青草、菜叶等农业种植废弃物替代部分畜禽粪便作为沼气发酵原料已成趋势。规模化沼气工程原料预处理设备有以下几类：

1.收获技术设备

目前，沼气工程原料的收获主要使用的是联合收割机。它能够实现作物收割、脱粒，能够完成籽粒与颖糠、碎屑、茎秆和其他杂物分离的大型农业机械，大型联合收割机还能进行作物籽粒清选、干燥和包装加工。按照行走系统划分，联合收割机分为轮式和履带式二种，根据方向操纵系统划分，分为方向盘式和操纵杆式二种。

2.切碎技术设备

在沼气工程中，原料来源广泛，主要是能源作物秸秆、青草、谷类、动物的粪便、垃圾等，它们中混有各种粒度较大的杂物，如鸡粪中的鸡毛、牛粪中的长草和沙砾等。因此，要采用切碎机对其进行切割、破碎，以保证下游泵和其它机械设备的运行安全，提高使用寿命。

切碎机通常设置在混料匀浆池和调浆暂贮池(发酵罐)间的输送环节，通过管道安装在输送泵前，依靠泵的抽吸作用使浆料通过切碎机。有的切碎机为了防止比重大的物料损坏切碎机工作部件，把切碎机进料侧容腔设计得较大，此处的介质流速较低，比重大的物料就会沉降，并可定期由人工取出。

3.输送技术设备

在原料输送方面，包含液态的浆料输送和固态的碎秸秆输送两个层面。我国现有的沼气工程多是利用畜禽粪便或污水等液态原料，所以螺杆泵是目前国内外沼气工程中应用最广泛的输送泵;但是螺杆泵也存在维修费用高、能耗高的缺点，对于TS浓度超过25%的原料输送也无能为力。针对这些情况，目前在欧洲有的沼气工程中采用了凸轮转子泵和高密度固体泵。