1、沼肥应随出随施，不宜久存。一般从沼气池中取出后，就应直接施到田里，实在忙不过来时，最多也只能堆放1～2天。时间拖得越久，氨态氮损失越多。一时不用的沼肥，应及时存放在有盖的桶中或粪池内，还可以加入0.1％～0.2％的过磷酸钙，使易挥发的氨态氮变成不易挥发的磷酸一铵和磷酸二铵，以保持肥效。

　　2、沼渣宜作为基肥深施。施用于水田时，最好是在耕田时使用，使泥、肥混合，每亩施用量大约2000公斤；施用于旱地时，最好是集中施用，如穴施、沟施，然后覆盖10厘米厚度的土层，以减少养分挥发。

　　3、沼液宜作为追肥施用。施用时，应根据沼液的质量和作物生长情况，适当掺水稀释，以免伤害作物的幼根或嫩叶。沼液可按一定比例结合灌溉施用，也可进行喷施。沼液可与尿素等化肥配合使用，沼液能帮助化肥在土壤中溶解，吸附和刺激作物吸收养分，提高化肥利用率。一般每50公斤沼液中可加入0．5至1公斤尿素。

　　4、沼液还可作为叶面肥喷施，既可补充养分，又可防治病虫害，适用于多种作物。叶面喷施一定要掌握好各种作物不同生长发育期施用的适宜浓度，以防烧坏叶面。一般作物在幼苗期用1份新鲜沼液加水1～1.5倍，瓜菜类作物幼苗期要加水1.5～2倍，作物生长的中后期以及果树的施用浓度，一般用1份新鲜沼液加水0.5～1倍较为合适。

　　5、将沼肥按1：1的比例与稻草、飞机草或其它杂肥（要切成10厘米左右）等混合堆沤30～40天，可制成堆肥。