科学实验和大田生产证明，沼液及其用沼液制备的生化剂可以防治作物的土传病、根腐病和赤霉病。

1、沼液防治大麦黄花叶病：大麦黄花叶病是一种蔓延于长江流域秋播地区的病害。它是由土壤禾谷类多黏菌侵袭大麦根系导致病毒侵入植株而引起的病害，病株开春后呈现萎缩、叶片黄花等症状，不能正常抽穗，结实，严重时颗粒无收。用沼液浸泡大麦种子，可以明显减轻这种病害，且病害随沼液浓度的增加而减少。用上海市农业科学院土壤肥料研究所研制的AFP(沼液＋少量生化剂)和AFS（沼液浸种后用沼液泥包粒）处理大麦种，黄花叶病发病率减少50%～90%，增产20%～50%。此外，沼液对大麦叶锈病也有较好的防治作用。

2、沼液防治西瓜枯萎病：西瓜枯萎病是一种顽固性土壤传播的真菌，分布广，传播快，地表至60厘米深度土壤中均带有病原菌，单纯用药剂防治很难见效，是西瓜生产的大敌。北京市大兴县能源办在西瓜生产中，每667米2施沼渣2000～2500千克作基肥，用20倍沼液浸种8小时后，在催芽棚中育苗移栽，美工在生长期叶面喷施10～20倍沼液3～4次，基本上可控制重茬西瓜地枯萎病大面积发生。即使有个别发病株，及时用沼液原液灌根，也能杀灭病原菌，救活病株。在西瓜膨大期，结合叶面喷施沼液，用沼渣进行追肥，不但枯萎病得到控制，而且获得较高的产量，西瓜品质也有所提高。

3、沼液防治小麦赤霉病：赤霉病是小麦生产中的主要病害之一，其发病率高，流行面广。陕西省土壤肥料研究所进行了沼液防治小麦赤霉病的试验，结果证明：正常发酵产气的沼气池的沼液对小麦赤霉病有明显的防治效果，其作用和生产上所用的多菌灵效果相当；使用沼液原液喷施效果最佳，使用量以每667米2喷50千克以上效果最好，盛花期喷一次，隔3～5天再喷一次，防治率可达81.53%。

此外，沼液对棉花的枯萎病和炭疽病菌、马铃薯枯萎病、小麦根腐病、水稻小球菌核病和纹枯病、玉米的大小斑病菌以及果树根腐病菌也有较强的抑制和灭杀作用。