沼气投料时，先按发酵浓度要求，根据沼气池有效溶积计算原料用量，打开活动盖板，拨掉导气管上的输气虚管，从活动盖口或进料口加入事先准备好的接种物，再加入新鲜的发酵原料（事先与水或沼液搅拌均匀至无块状物）。将接种物和原料在池内充分搅拌均匀后，向池内加入清水至投料线（零压线），再次搅拌均匀后，将活动盖板密封，接上导气管，完成投料。启动投料时，切记勿使用鸡粪，否则容易造成发酵料液严重酸化,鸡粪是强酸性的（PH值为3.6～4.7）。

农村沼气发酵的湿易温度在15℃以及上。因此，投料应选择在气温较时进行。北方地区应在3月份准备发酵原料，在4～5月投料；南方地区除在4～5月可1：2投料外，下半年宜在9月份准备原料，10月份投料，超过11月份，气温普遍较低，沼气池的启动缓慢，沼气发酵周期延长。投料的时间选择应根据当地实际气候决定，不强求一律。例如，有些地区常年气温较高，这些地区投料就可以不受时间、季节的限制。此外，投料宜选在午后进行。为了更好地和快速启动沼气池，应在当天完成投料、封池。